Осенью 1940 года был призван в Советскую Армию и служил в зоне Брестской крепости. В первые же дни войны, будучи контуженным, Зубайдуллин Ш.В. оказался в плену у гитлеровцев и находился в лагере Б-IV близ Мюльберга на Эльбе. (7 янв 1940 г.