Poco es lo que se conoce sobre la familia de Andrés Guacurarí. Tan solo que hay registros de su apellido en el antiguo pueblo jesuita de San Borja, por lo que se supone que los Guacurarí eran originarios de allí. Ya en el marco de la revolución y la independencia aparece un Lorenzo Guacurarí, que se presume era hermano del prócer misionero.
Durante la ocupación de Corrientes, en 1818/1819, las fuentes registran la presencia de una mujer de Andresito, llamada Melchora Caburú, quien lo acompañó durante esos meses. Tampoco se conoce si Andrés tuvo hijos, ya sea con Melchora u otra mujer.
