В Windows ME впервые появилось много возможностей, характерных для «старших» версий линейки NT.
Основные нововведения:
Конфигурация загрузки в реестре; Восстановление системы (System Restore); Защита системных файлов (Windows File Protection); Автоматическое обновление с веб-узла Windows Update (обновление с сервера WSUS не поддерживается); Распознаются съёмные устройства USB, Firewire и т. д. с возможностью их безопасного извлечения. Справочная система в новом стиле; Неиспользуемые пункты меню «Пуск» автоматически «прячутся»; Поддержка нового оборудования; Новые возможности по настройке сети: Поддержка новых технологий подключения: ADSL и кабельные модемы; Общий доступ к подключению к Интернету (Internet Connection Sharing). Поддержка устройств UPnP; Новые возможности мультимедиа: Интернет-браузер Internet Explorer 5.5; IM-клиент MSN Messenger, интегрированный с NetMeeting. Может передавать не только текст, но и звук с видео (видеоконференции); Проигрыватель Windows Media 7.0; Программа для создания и редактирования собственных фильмов — Windows Movie Maker. Интегрированы игры, которые ранее были доступны только в пакете «Microsoft Plus!»[2]. Поддержка спящего режима компьютера (работала далеко не всегда, так как была очень требовательна к оборудованию); Новая возможность Панели управления — показывать только часто запускаемые компоненты; Усовершенствования внешнего вида Проводника — добавление новых функций Internet Explorer (дополнительные окна, журнал, более удобный поиск), добавлен предварительный просмотр файлов. Windows Me загружалась быстрее, чем предыдущие версии — это достигалось за счёт того, что программа Microsoft ScanDisk была интегрирована в интерфейс системы. Общее время загрузки достигало 54 секунды против 86 секунд у Windows 98 SE[3].